Het Waterloopbos, in beheer bij Natuurmonumenten, is een historisch openluchtlaboratorium in het bos. Er zijn sinds de jaren vijftig honderden onderzoeken uitgevoerd naar het gedrag van water. Zo zijn er restanten van het onderzoek naar de Deltawerken, maar ook van waterwerken voor exotische plekken zoals de haven van Lagos op kleinere schaal te zien.  Het Waterloopbos is vorig jaar net opgeknapt met een nieuw bezoekerscentrum, entree en horecazaak, dankzij bijdragen van de provincie en de gemeente Noordoostpolder.

Gemarkeerde wandelroutes leiden langs de modellen van waterwerken die als ruïnes in het bos liggen. De modellen zijn gebouwd door het voormalige Waterloopkundig Laboratorium De Voorst. De oudste modellen dateren uit de jaren vijftig. 

Het bos is een van de twaalf cultuurhistorische iconen die nu steun krijgen van de Rijksoverheid. Van Engelshoven verdeelt een pot van 35 miljoen euro. Onder andere Kasteel Amerongen, de rijksmonumenten in Diergaarde Blijdorp, Abdij Rolduc en de Sint Jan Kathedraal in Den Bosch krijgen ook steun. Daarnaast krijgen de verschillende museumhuizen van Hendrick de Keyser samen een half miljoen euro.